在一些營(yíng)養(yǎng)豐富的水體中，有些藍(lán)綠藻常于夏季大量繁殖，并在水面形成一層藍(lán)綠色而腥臭味的浮沫，稱(chēng)為“水華”，大規(guī)模的藍(lán)綠藻爆發(fā)，會(huì)引起水質(zhì)惡化，嚴(yán)重時(shí)會(huì)因?yàn)楹谋M水中氧氣而造成魚(yú)類(lèi)的大量死亡，造成不可估量的經(jīng)濟(jì)損失。更為嚴(yán)重的是，藍(lán)綠藻中有些種類(lèi)（如微囊藻）還會(huì)產(chǎn)生毒素，大約50%的藍(lán)綠藻爆發(fā)中含有大量毒素。這些毒素除直接對(duì)魚(yú)類(lèi)、人畜產(chǎn)生毒害之外，也是肝癌的重要誘因。

從本質(zhì)上來(lái)說(shuō)，藍(lán)藻是原核生物，又叫藍(lán)綠藻藍(lán)細(xì)菌；大多數(shù)藍(lán)藻的細(xì)胞壁外面有膠質(zhì)衣，因此又叫粘藻。在所有藻類(lèi)生物中，藍(lán)藻是最簡(jiǎn)單、最原始的一種。藍(lán)藻是單細(xì)胞生物，沒(méi)有細(xì)胞核，但細(xì)胞中央含有核物質(zhì)，通常呈顆粒狀或網(wǎng)狀，染色質(zhì)和色素均勻的分布在細(xì)胞質(zhì)中。該核物質(zhì)沒(méi)有核膜和核仁，但具有核的功能，故稱(chēng)其為原核（或擬核）。在藍(lán)藻中還有一種環(huán)狀DNA——質(zhì)粒，在基因工程中擔(dān)當(dāng)了運(yùn)載體的作用。和細(xì)菌一樣，藍(lán)藻屬于“原核生物”。

藍(lán)綠藻水質(zhì)監(jiān)測(cè)方法
富營(yíng)養(yǎng)化是中國(guó)河流和湖泊水體普遍面臨的嚴(yán)重問(wèn)題。測(cè)量水體中的藻類(lèi)密度和濃度就成為環(huán)境監(jiān)測(cè)的重要指標(biāo)之一。但是由于藻類(lèi)的形成不僅與水質(zhì)因素密切相關(guān)，而且與氣象條件關(guān)系密切，因此，在監(jiān)測(cè)藍(lán)綠藻時(shí)時(shí)，人們往往不能只單純的選擇一個(gè)或者有限的幾個(gè)指標(biāo)進(jìn)行監(jiān)測(cè)，通常人們會(huì)對(duì)氣象和水質(zhì)進(jìn)行綜合的監(jiān)測(cè)。
通常測(cè)量和監(jiān)測(cè)藍(lán)綠藻的方法有兩種：計(jì)數(shù)法和熒光法，計(jì)數(shù)法雖為國(guó)標(biāo)方法,但是因?yàn)橘M(fèi)時(shí)和難以作到實(shí)時(shí)的數(shù)據(jù),難以跟蹤水體變化，因此只適合于作實(shí)驗(yàn)室里的測(cè)量方法；而熒光法因?yàn)槟鼙O(jiān)測(cè)水體的實(shí)時(shí)數(shù)據(jù)，因此使得藍(lán)綠藻在線監(jiān)測(cè)成為可能。